SUK: Můžeš, ale mě se to osvědčlo takhle (/, /home, swap). Zálohovat něco dalšího není problém, mít proto zvlášť oddíl na disku nemusím(naopak starší záloha se může hodit).
Pokud by mě to moc trápilo, můžu udělat /var a /etc jako link na /home/var a /home/etc, ale netrápí.
Proč to dělat? Měníš distribuci, něco sis rozbil, zkoušels programy a už ani nevíš jak se jmenují, chce se ti, ... Není to nutnost, ale občas je to dobrý nápad.