• úvod
  • témata
  • události
  • tržiště
  • diskuze
  • nástěnka
    • přihlásit
    registrace
    ztracené heslo?
    BORAGOrganická syntéza
    Tento klub slouží k procvičování schopnosti navrhovat jednoduché i pokročilé mnohakrokové organické syntézy. Navrhovatel řešené struktury (tj. jedinec, který úspěšně vyřešil předchozí syntézu) by měl volit látku, se kterou již dříve pracoval, aby byl schopný rozsoudit správné řešení, v případě, že se jich objeví více.

    Prosím respektujte následující pravidla:
    1. Při navrhování syntéz používejte jako reagenty pouze komerčně dostupné látky.
    2. Syntéza by neměla mít více než deset kroků.
    3. Navržený sled reakcí vkládejte ve formě obrázků! Slovní popis n-stupňové syntézy nebude nejspíš nikdo číst.
    4. Doba na vyřešení struktury je předběžně stanovena na JEDEN TÝDEN - pokud se do té doby nepříjde s vhodným řešením, je navrhovatel povinen zveřejnit správné znění. Dalším navrhovatelem se pak stává osoba, která se k tomuto řešení nejvíce přiblížila.
    5. Navrhovatel se může své funkce dobrovolně vzdát ve prospěch jiného diskutujícího.
    6. Navržena může být i struktura, kterou plánujete připravit a rádi byste postup zkonzultovali, popř. zjistili i jiné úhly pohledu.
    7. Jakékoliv příspěvky mimo téma diskuze budou nemilosrdně mazány.

    Přeji příjemnou zábavu!
    rozbalit záhlaví
    BORAG
    BORAG --- ---
    1 odpověď
    CHEMIK: není potřeba přesněji - tohle je dost vyčerpávající odpověď :-) Já se v chemii těchhle steroidních systémů moc nevyznám. Některé věci tam probíhají dost nepředvídatelně a proto mě to docela zajímalo.
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    1 odpověď
    BORAG: Ja to nedelal na steroidu, ale na terpenu, ktery mel na C-4 dva methyly a tim to bylo jasny. Presto predpovidam, ze i na tomhle steroidu to pujde prevazne (ale ne 100 %) do pozadovany polohy na C-2, protoze tahle poloha je vyrazne reaktivnejsi (+stericky pristupnejsi). Vedlejsim produktem urcite bude heterocyklus na "druhou stranu", ale to pujde normalne chromatograficky/krystalizacne rozdelit.
    A kdyz uz mam cucat z prstu, muj odhad pomeru bude 60 % muj produkt, 20 % na C-4 a zbytek se vypari do etheru ;-). Ale mozna to nekde najdes presnejc, jak to funguje v prumyslu...
    BORAG
    BORAG --- ---
    1 odpověď
    CHEMIK: to já bych se ještě zeptal na tuhle syntézu. V jakém poměru budou vznikat alkylované deriváty v šestém kroce. Přeci jenom má ten keton dva alfa-uhlíky. Nebo to z nějakého důvodu běží pouze do té "požadované" formy. Pokud ne, tak jakým způsobem jsi to dělil?
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    WILDENBURY_SQ: Myslel jsem fosforamidit od toho nucleosidu samozrejme, na 3' ;-). Tenhle chlorofosforamidit mam v lednici a pouzivam ho na pripravu DNA.
    WILDENBURY_SQ
    WILDENBURY_SQ --- ---
    1 odpověď
    co jsem jentak chvilku hledal, maji ho jen nejak substituovany, treba tady
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    Ty P znamenaji uz fosfaty v retezci, doufam ze je to pochopitelny. Jo, z komercne dostupnych chemikalii, PS: jestli nekdo naleznete firmu, ktera dodava rovnou fosforamidit, tak me picne ;-)
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    Tak, zkusim to. Jak byste syntetizovali chemicky (ne enzymem) kus DNA o tehle sekvenci: T20GCCCXAT14, kde X je modifikovany deoxyribonucleosid, jehoz struktura je na obrazku. Samozrejme, nechci opakovat tech 40 cyklu, jen princip a hlavne jak se dostat k tomu modifikovanemu nucleosidu.

    LIBRIUM
    LIBRIUM --- ---
    CHEMIK: toto konkretne je stanozolol (Winstrol), silne ucinny anabolicky androgenny steroid (dava sa napriklad vo veterine pracovnym konom v rekonvalescencii;).
    obrazok vkladas tak, ze ides napriklad na http://imageshack.us/ , -->upload to co chces (v uvedenych formatoch), uploadnes to a nasledne skopirujes URL obrazku. to potom vlozis sem.
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    Jak sem hergot davate obrazky?? ;-).
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    1 odpověď
    LIBRIUM: Kdyz ja to vetsinou nevymyslim, nekde se kousnu a tak sem svy napady ani radsi nepisu. Jenze tohle byla takova navnada jako kus syra pro mys ;-), protoze pyrazol na A-kruhu jsem delal u terpenu (kys. betulinovy a allobetulonu) v ramci dizertace. Melo to mirne cytotoxicky ucinky proti T-lymfoblasticky leukemii CEM (IC50 ca 14 uM/L). Jinak, jaky biologicky vlastnosti maj tyhle steroidy?
    LIBRIUM
    LIBRIUM --- ---
    1 odpověď
    CHEMIK: vyborne;) a som rad, ze si sa zapojil;)
    tu je tebou navrhovany postup ilustrovany:



    mozes zadat dalsiu molekulu.
    CHEMIK
    CHEMIK --- ---
    2 odpovědi
    LIBRIUM: Ses mi skoro strefil do dizertace. Neumim pastovat obrazky, tak tedy posloupnost reakci:

    1. TBDMSCl, py, ochrana 3-OH.
    2. MeMgBr, stereoselektivita by mela byt OK jednoznacna, diky methylu v poloze 13.
    3. Ac2O, py, ochraneni 17-OH
    4. TBAF, THF. Odchraneni 3-OH.
    5. CrO3, DMF, oxidace 3-OH na 3-oxo.
    6. NaH, dioxan, refl., pak prikapavat HCOOEt, vznikne 2-(hydroxymethylen) substituovany steroid (enolforma aldehydu)
    7. N2H2, dioxan, refl.
    8. hydrolyza acetatu, treba NaOH, dioxan, ethanol, H2O (rozpustnost). Tenhle krok lze zaradit i pred krok 6, kdyz se pak pouzije nadbytek NaH.
    LIBRIUM
    LIBRIUM --- ---
    na dlhe vecery: pokuste sa o pripravu "1" z "2".

    PETER_PAN
    PETER_PAN --- ---
    ALL: tak panove dekuji vsem za napady.. zitra se pustim do prohledavani literatury a potvrzovani ci vyvraceni jednotlivych kroku na stejnych nebo podobnych substratech ..
    BORAG
    BORAG --- ---
    LIBRIUM: ano, dusičnanem stříbrným sestřelíš trityl, většinou to v tom acetátovém pufru běží velmi rychle. Pak thiol chloruješ NCS a následně to aduješ na akrylonitril. Vzniklý chlormethylen-derivát dehydrochloruješ pomocí TEA (jak jsi psal). Tyhle kroky by měly, stejně i ta metateze.
    Imho problém bude na to jádro dostat acetylovou skupinu a pak to oxidovat. Zbytek by "nějak" mohl jít...
    LIBRIUM
    LIBRIUM --- ---
    1 odpověď
    BORAG: tie 4 kroky pred tou metatezou su mi stale nejasne. takze ten diMeotrityl odstiepis ako? a potom adicia na akrylonitril, tam adujes chlorsulfen a potom dehydrochlorujes, alebo ako?
    a myslis, ze ta metateza s uzavretim kruhu pojde z toho "laktonu/diketenu"?
    BORAG
    BORAG --- ---
    1 odpověď
    (tedy ale nevím, jestli bych se dobrovolně pustil do přípravy této látky. Tak nějak cítím, že s tím budou ukrutné problémy)
    BORAG
    BORAG --- ---
    ne, nejde - já byl jen líný rozepisovat ten volný thiol :-)
    LIBRIUM
    LIBRIUM --- ---
    BORAG: ide deprotekcia tritylsulfidu Ag+ nasledovane NCS?
    BORAG
    BORAG --- ---
    1 odpověď
    tak taky přihodím svou trochu do klína, ale za některé kroky teda ruku do ohně nedám. Hlavně ta oxidace methylu v přítomnosti síry a methylketonu bude oříšek.

    PETER_PAN
    PETER_PAN --- ---
    LIBRIUM: jj, dobree
    Kliknutím sem můžete změnit nastavení reklam